基隆八堵山:主要為海膽化石具多,台灣裂星海膽、 壺海膽、拉文海膽、生痕化石....等等。


北市汐止山:海相類為主 ,壺海膽、 曼氏星海膽、史丟得海膽、拉文海膽、裂星海膽、貝類、海綿。


桃園大溪:主要以螃蟹化石為主,其中以顆粒靜蟹為最多,同時出土過大型鯨魚脊椎骨。


苗栗龍港:當海水退潮時一大片化石裸露於地表上主要以軟體動物貝類為主,其中有少數棘皮動物;如俗稱五孔海膽、大型包型海膽、剛毛海膽等。


苗栗通宵:化石主要採集區在化石山當海水退潮時,一大片化石裸露於地表上,其種類跟龍港相同。


南投中寮:地層為中新世主要化石為貝類,其中以鸚鵡螺翁戎螺為最珍貴。棘皮動物以臉譜型海膽為最多。


嘉義牛埔:全省主要化石採集區,地層屬二重溪層更新世,其化石種類繁多如魚類脊椎骨、魚類牙齒、魚類頭骨、魚類耳石等,甲殼動物出土過46種,其中比較珍貴有薛氏蟹、鬼面蟹、台灣玉蝦、軟體動物之各種貝類,其中以頭足綱之闊船蛸為最有名,棘皮動物有王冠海膽、五孔海膽、包型海膽、剛毛海膽等。


台南菜寮:主要化石為陸相為主如犀牛腿骨、犀牛齒、象牙、象齒、鱷魚齒、鱷魚骨、牛、鹿、野豬等,地層為崎頂層(更新世)


台南玉井:地質為六重溪層上新世化石為貝類、海膽、螃蟹及魚類牙齒。


高雄甲仙:地層為南莊層(中新世)化石以貝類為主,其中以甲仙翁戎螺滿月蛤最為珍貴。魚類牙齒、海膽、螃蟹比較少見。


高雄大岡山:化石為石灰岩層(更新世)貝類以大型滿月蛤、馬蹄螺、夜光螺、大硨磲蛤等比較珍貴,棘皮動物以海膽比較多。


恆春四溝投溝:地層為四溝層(更新世)化石為貝類、螃蟹、海膽、籐壺、腕足類、魚類、哺乳類等...可謂豐富化石群。

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